3、机动舰/潜艇
在《文明6》中，机动舰与潜艇系列为海上作战提供了多种战术选择。它们从基础的私掠船起步，逐步升级为更强大的潜艇，最终到达核潜艇阶段。每个单元拥有独特的移动力、攻击力以及维护成本，能够满足不同文明的战略需求。以下列出各单位的核心属性与特色。
私掠船
移动力 4；近战 40，远程 50；射程 2。作为基础海军单位，擅长骚扰和快速打击。基础花费 260 生产力、1030 金币；维护 3 金币/回合。可升级为潜艇或 U 型潜水艇。
海猎犬
英国专属单位，移动力 4；近/远 40/50；射程 2。击败敌舰后可有机率俘获，且能够让附近海军暴露位置。取代私掠船，可升级为潜艇或 U 型潜水艇。花费 280 生产力、1120 金币，维护 4 金币。
巴巴里海盗
奥斯曼特定，移动力 4；近/远 40/50；射程 2。海岸扫荡时无需消耗移动力，且同样能让敌海军暴露。取代私掠船，升级为潜艇或 U 型潜水艇。花费 240 生产力、960 金币，维护 3 金币。
潜艇
移动力 3；近/远 65/75；射程 2。以 U 型潜水艇为蓝本，可进一步升级为核潜艇。基础花费 480 生产力、1 石油、1920 金币；科技需求 电力；维护 6 金币/回合，并消耗 1 石油。
U 型潜水艇
德国专属，移动力 3；近/远 65/75；射程 2。相较于潜艇成本更低，额外获得 +1 视野，海洋单元格战斗力提升 10，且能发现隐形单位。可升级为核潜艇。花费 430 生产力、1 石油、1720 金币；科技 电力；维护 6 金币/回合，石油消耗同上。
核潜艇
移动力 4；近/远 80/85；射程 2。作为潜艇与 U 型潜水艇的终极升级，提供更高的攻击力。基准花费 680 生产力、2720 金币；科技 远程通信。升级自潜艇或 U 型潜水艇。