主线-任务十四：云爆
蝙蝠侠先行调查地震的根源，原来是一群坦克闯入了毒藤女的古树所在地点。毒藤女会在古树的攻击范围内利用藤蔓协助蝙蝠侠清除这些坦克，因此战斗主要集中在该范围内即可。
第一波战斗结束后，面对五台眼镜蛇坦克时，毒藤女已无法协助。蝙蝠侠驾驶蝙蝠车跟踪眼镜蛇坦克，找出其弱点并用60 mm炮摧毁它们，随后便可前往古树与毒藤女会面。
剧情发展：阿甘骑士再次攻击毒藤女，蝙蝠侠打算将毒藤女带回GCPD。就在此时，阿甘骑士释放第一阶段的云爆，导致毒气笼罩整个葛咸城。受毒气影响的人们会陷入疯狂与暴力，电器（包括蝙蝠车）也会失效。毒藤女的植物正在枯萎，她只能在古树内部尽力过滤毒气。若蝙蝠侠不摧毁云爆，毒藤女与其植物将无法保护葛咸城。
云爆的能量场损坏了蝙蝠车的动力核心，制造云爆的斯塔格一定有办法消除能量场的干扰。蝙蝠侠前往斯塔格的飞艇，击退入口处的守卫。利用调制器合成斯塔格的声纹后，可再次进入飞艇内部。
在飞艇内部，佣兵正在搜寻斯塔格，而斯塔格早已从毒气箱逃离。通过调制器，蝙蝠侠可用阿甘骑士的声音指令守卫去调查易爆品（如电箱），当守卫靠近后即可引爆将其击晕。飞艇内还有两架无人机，可通过入侵其系统让其袭击敌方。
清理敌人后，蝙蝠侠在毒气箱使用扫描仪寻找斯塔格的掌纹，最终在一层存放猩猩实验品的走廊地道内发现他。蝙蝠侠逼迫斯塔格交出不受云爆干扰的车载电池。
蝙蝠侠随后需在毒气中安装该抗干扰电池。由于防毒面具无法长时间使用，他必须在毒气箱出口迅速返回外部，前往蝙蝠车所在位置。安装方法与之前实验室放置中和剂相同，需要慢慢移动鼠标以拆卸/安装电池，期间会有暴徒袭击，右键即可解决。
目前云爆毒气污染范围广阔，蝙蝠侠需借助蝙蝠车的声呐寻找第二棵古树。抵达后发现树深埋地下，蝙蝠侠需前往地下修筑现场多次使用声呐发射器进行定位。
接下来驾车前往集装箱堆场，面对大量坦克与新增无人机，最适合使用机枪炮进行摧毁。西侧有飞弹发射器，摧毁后可利用旁边的倾斜板驾车飞入亚当斯港内部。
在狭窄的货场内与第二批坦克和无人机交战后，乘坐电梯可下到正在建设的隧道。
第一段隧道需驾驶蝙蝠车走上倾斜面以躲避障碍。抵达第一道闸门前，蝙蝠侠离开蝙蝠车进入地下通道，随后骇入坦克车即可继续前进。