清理完毕后，前往大厅中央的电梯处进行密码破解。进入电梯后需再次破解密码。电梯上升至奇迹塔一定高度会停止，此时不要从电梯门出去，而是跳上电梯顶部。发现外面有大量守卫埋伏，投掷烟雾弹后跳下清场。在瞭望台破解栅门，然后沿着高塔外壁攀爬，当遇到长横杆时，走到其末端回头向高处观察，即可找到挂钩索的位置。
到达上层平台后进入塔楼内部破解密码，该锁有多种组合，正确密码为“MAINTE NANCE”。进入安全控制中心区域，扫描到六名武装守卫。通风道分别通往安全中心室内和外部阳台，需逐一清除守卫。随后破解大厅二层中央房间的密码锁，同样有多重组合，正确密码是“GOTHAM SAVIOR”。
进入房间后将斯特恩奇博士踢飞，让先知中止该处程序。斯特恩奇仍辩称蝙蝠侠无法阻止他的计划，他将支配超越蝙蝠侠理解的力量。此时他被利刃刺杀，刺客联盟的拉斯现身。原来拉斯是斯特恩奇的幕后主使，现放弃博士，欲与蝙蝠侠联手清扫世界污秽。
垂死的斯特恩奇博士说出“十一号协议”口令，正是蝙蝠侠的姓氏，可用其终止拉斯的“十号计划”。控制中心爆炸，蝙蝠侠与拉斯一同跃下奇迹塔，拉斯拒绝救援，自尽而亡。
蝙蝠侠向先知说明情况，大屏幕上出现小丑影像。他劫持了塔莉亚，随时可能处决她。蝙蝠侠需尽快赶去找小丑夺取解药，并阻止他变成不死之身。
