请握紧你的蛛丝发射器，准备在纽约的高楼大厦间穿梭。故事从迈尔斯走下地铁开始，作为帮母亲跑腿的他，今天也过着看似普通的一天。
承接前作的剧情，虽然迈尔斯作为“新蜘蛛侠”已逐渐被大众知晓，但相比于这位“新面孔”，大家似乎还是更习惯彼得这位“老前辈”。
来到杂货店前，彼得发来了通讯，原来他们今天有任务在身，需要协助护送政府转移犯人的押送车。
正式开始操作，与前作一样，按下“Shift”键即可在楼宇间进行帅气的摆荡。不过本作略有优化，摆荡时的跳跃和俯冲动作默认即解锁，无需再单独学习技能。
与彼得汇合后，一路跟随押运车前进。剧情突然发生转折，犀牛人意外挣脱了束缚，冲破集装箱在街道上肆意破坏。
强力的对手交给彼得处理，作为新人的迈尔斯则负责对付普通囚犯。此时会进入新手教程，教导如何进行远程攻击与近身格斗。
在追捕犀牛人的过程中，需要注意避免撞击障碍物，否则会扣除血量，不过只要稍加留意通常不会有大碍。
一路追至发电厂，尽管彼得一直在呼救，但信任他的迈尔斯决定先清理周围的囚犯。然而英雄也有失手时，这次蜘蛛侠不敌犀牛人，倒地不起。
关键时刻，迈尔斯觉醒了新能力，一记重拳击退了犀牛人。这正是他作为新一代蜘蛛侠的特色——能够主动使用名为“毒液拳”的技能，利用生物电强化攻击。
对犀牛人重复使用“闪避+毒液拳”的循环将其击退，即可进入下一阶段剧情。事件结束后，新能源公司首席西蒙·克里格登场，他对蜘蛛侠这样的超级英雄似乎并不排斥。
事后，迈尔斯与彼得在屋顶交谈，得知彼得将随简出国一段时间，迈尔斯需要暂时担下守护城市的重任。完成本章后，将解锁“技能树”系统。
每次升级获得技能点后，可自由分配在技能树上。在菜单的“招式列表”分页中，可以随时查看已学会的招式。
