幻影人因为无法接受背叛人类的后果而选择了自我了断。薛帕德此时的话语仅仅是陈述了残酷的事实。不过，想要达成说服的目的，必须拥有足够的声望值。好在《质量效应3传奇版》中并不缺声望，只要完成大部分支线任务，声望自然会达标。
安德森因重伤陷入长眠，就在薛帕德也身受重伤准备随他而去时，收割者发出了召唤。面对薛帕德的到来，收割者指出了三条道路（前提是二代未摧毁收集者基地）。
首先是“摧毁”结局。顾名思义，就是彻底消灭收割者，但这种合成体生物终究会被再次创造出来，新一轮的收割在未来依然无法避免。战力数值决定了地球的命运：低于1750将导致地球毁灭；达到1900则是地球濒临毁灭；唯有达到2650，才能成功拯救地球。
其次是“控制”结局。这相当于重走幻影人的老路，通过操作收割者为人类服务，达成和平共处。达成条件如下：①. 战力达到1750：地球仍会遭受破坏。注：如果前作保留了收集者基地，战力达到1750时可选择摧毁而非控制。②. 战力达到2350：能够成功拯救地球。
最后是“合成”结局。该结局让有机体与机械体融合，诞生出半机械生命。既然不再存在纯粹的有机体或机械体，机械体也就没有理由再去收割有机体了。达成条件为：战力达到2800。
在所有结局中，薛帕德和安德森都注定死亡，至少肉体是消亡了。两人的名字被铭刻在诺曼底号的纪念碑上。需要注意的是，如果战力不足1750，诺曼底号也会被摧毁，仅留下莉亚娜的信标，如同普洛仙信标一般警示着后来的种族。
