序章：觉醒与攻略指引
本篇指南将重点介绍渗透者职业与模范路线的通关方式，致力于达成全员存活、队友忠诚的圆满结局。在感情线方面，强烈推荐与助手凯莉发展关系，毕竟在众多性格迥异的队友中，她是最为正常的人类伙伴。重制版主要在画质上进行了高清优化，剧情与玩法与原版保持一致。
故事背景设定在2183年，统治宇宙的神堡理事会遭遇了桀斯机械大军的入侵。这些桀斯实则是收割者的爪牙，而收割者是每隔五万年便会清洗宇宙文明的古老机器。薛帕德指挥官成功领导了防御战，并在战后受命清剿残余的桀斯势力。
然而在执行任务途中，薛帕德遭遇伏击不幸阵亡，诺曼底号亦随之损毁，仅有少数船员幸存。此时前往舰桥寻找驾驶员小丑即可推进剧情。
薛帕德阵亡后，被被理事会视为恐怖组织的人类至上团体——塞伯鲁斯寻获遗体，并启动了代号为“撒拉路计划”的复活工程。若未体验过初代作品，可在后续剧情中选择一代背景设定。
此部分主要回顾一代剧情，讲述薛帕德生前对抗收割者，并击败被其控制的幽灵萨伦的历程。玩家需在此处设定剧情分支，例如选择初始恋人（男性角色可选莉亚娜或阿什利，女性角色可选凯登）。建议选择莉亚娜，因为她将在本作中作为队友登场，而阿什利与凯登在本作中戏份较少。
在虫女王与克罗格队友的剧情中，建议选择拯救路线以达成圆满结局。随后是关键选择：阿什利与凯登中仅一人幸存，选择任意一位即可，幸存者将在本作短暂露面，并于三代正式回归成为队友。
最后关于支持安德森还是乌迪那的抉择，实际上无论怎么选结果都一样，大使始终由乌迪那担任。若选择支持安德森，他在剧情后期会因薛帕德阵亡而辞职。
职业选择分析： 1. 战士：精通各类枪械与弹药，适合正面硬刚。 2. 渗透者：擅长狙击步枪与隐身潜行，适合远程偷袭。 3. 先锋：精通霰弹枪与异能，主打近身战斗。 4. 哨兵：不精于枪械，但科技与异能技能均衡。 5. 异能者：极度依赖异能，枪械能力弱，玩法与战士截然不同。 6. 工程师：擅长召唤浮游机兵等科技技能，专门克制机械敌人。 职业无绝对优劣，本攻略推荐选择渗透者。
