水晶骷髏總共有10個，每關必定會出現一個。進入修羅道後，需要連續挑戰四波敵人，前三波為雜兵戰，最後一波則是BOSS戰。每完成一波雜兵戰，系統都會進行一次評分。成功擊敗BOSS後，可獲得大量的Karma點數獎勵。完成一次完整的水晶骷髏修羅道挑戰後，總共可以獲得50000分的Karma獎勵。此外，修羅道內的敵人兵種配置會根據難度的不同而有所變化。
Day 1：鋼鐵蜘蛛戰役後
水晶骷髏位置：在鋼鐵蜘蛛的BOSS戰結束後，會有一場雜兵戰。清場後，利用苦無攀爬牆壁。抵達頂層後，不要急著打開通往官邸的大門。先爬上樓頂並一路向前走，會看到一堵下方有空隙的牆，使用裡風滑過這堵牆，繼續走到底即可發現水晶骷髏，不過沿途會有幾隻雜兵干擾。
敵人配置： 第一波：槍兵與火箭兵（超忍難度：魔神闇影+猩猩；極忍難度：魔神闇影+猩猩） 第二波：黑盔甲兵與狗（超忍難度：無；極忍難度：無） 第三波：槍兵與魔神暗影（超忍難度：無；極忍難度：無） 第四波：BOSS戰
BOSS：三大重鬼卿 - Doku。擊敗後可獲得10000分Karma獎勵。
Day 2：列車上方
水晶骷髏位置：利用裡風滑過直升機殘骸，抵達準備搭乘的火車前時，右手邊有幾塊殘骸可以跳上去。一路向上跳躍並吊過單槓，接著利用壁走抵達列車的頂部，水晶骷髏就放置在該處。
敵人配置： 第一波：槍兵+火箭炮兵+小紅帽（超忍難度：黑盔甲兵+持盾黑盔甲兵+魔神暗影；極忍難度：無） 第二波：黑盔甲兵+持盾黑盔甲兵+火箭炮兵（超忍難度：小白帽+自爆魔神；極忍難度：無） 第三波：阿紫+飛天阿紫（超忍難度：狗+鐮刀怪；極忍難度：無） 第四波：BOSS戰
BOSS：四殺重鬼王 - 風神沃夫。擊敗後可獲得10000分Karma獎勵。
綾音 Day 2：深淵洞穴
水晶骷髏位置：在一段需要飛鳥返上的路途中，需利用連續壁走越過巨大的窟窿。越過坑洞後，先不要前進，將視角轉向窟窿的方向，會發現剛才經過的牆壁上有一道藍色油漆線條。沿著這條線條跳躍並不斷使用壁走，接著會遇到一個單槓，盪過去後落在高臺上。從高臺繼續壁走前進，會抵達一個有低矮欄杆的平臺，平臺底部有一面可用苦無攀上的牆。一路攀爬上去後，會進入牆上的一條窄道，窄道盡頭有一個垂直落下的洞穴，往下跳即可抵達水晶骷髏所在之處。
敵人配置： 第一波：魔神闇影+持盾黑盔甲兵（超忍難度：無；極忍難度：無） 第二波：綠眼機甲忍者+狗（超忍難度：無；極忍難度：無） 第三波：魔神闇影+小紅帽（超忍難度：無；極忍難度：無） 第四波：BOSS戰
BOSS：四殺重鬼王 - 火神桑德尼斯。擊敗後可獲得10000分Karma獎勵。