在《淑女同萌!-Superior Entelecheia-》中，你可以了解到未来事件的进展。21世纪是发现和新的机会的时期，但实际上这个时代给人类带来了许多问题。因此，人们现在把重点放在年轻人身上——这些聪明的人可以带领人类走向繁荣、进步、技术和其他发现。游戏的故事将从一个年轻但非常雄心勃勃的女孩的角度展开。 在《淑女同萌!》中存在一个名为Amakawa的贵族学院，这里招收所有有前途的人。在这里，他们被教导如何利用才能造福社会，学习新事物，并逐步完善自己的能力。这里不会有粗犷未驯的壮汉——年轻的男男女女在这里学习学科，参加考试和其他规范。这个组织的领导是皇冠——这是5个最美丽和最有能力的女孩。 有一天，名为Saku Otanashi的皇冠首领遭遇了恐怖袭击。她已经告别了生命，就在这时，一个年轻的男子赶到了她身边。他是一名翻译学生，同时也是第6位皇冠成员。名为Shinri Narita的救世主向这位女孩宣称，她现在在学院里教授的系统让他不满意。因此，他们之间发生了冲突。但这个年轻人已经为自己做出了决定——他希望彻底改变并重新教育这五个自以为是的女孩。
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