在《英雄立志传：三国志》中，若想实现攻城略地、统帅千军万马的目标，军团战是必不可少的环节。游戏中的战斗主要分为三种，其中军团战是实现统一华夏的关键。许多玩家对这一机制尚不了解，实际上军团战主要包含野战与攻城战两种类型。
关于军团战的具体机制：攻城战会沿用内政建设中的城市地图。作为防守方，可以在街道两侧布置大量哨塔，即便城门失守，也能在巷战中利用箭雨重创敌军。
每位武将都拥有独特的军魂与军魂技。军魂相当于部队的被动技能，而军魂技则是主动释放的武将绝技，两者均可自由调整搭配。游戏中提供了数百种特色各异的军魂技，通过获取技能书，可以为家族成员及麾下武将学习，使其成为战场上的得力助手。
除武将技能外，各兵种还具备专属战法。只要兵种适性达标，任何武将都能在战斗中释放。例如骑兵的「突击」可快速追击敌军，造成强大的初次接触伤害；枪兵的「枪阵」虽会限制移动，但能大幅提升防御并反弹伤害。兵种战法间存在克制关系，若骑兵贸然突击处于枪阵状态的枪兵，往往会吃大亏。
战斗中，每个小队可保持固定阵型，获得大量攻防属性加成。例如锥形阵能提升攻击与移动速度。部分武将技可将敌方部队打乱成无阵状态，使其丧失阵型带来的属性增益。
当小队士兵全灭时，武将并不会立即撤退，而是以「落单武将」身份继续在战场作战。强力武将即便落单，仍能凭借高武力对敌军造成可观伤害，并继续释放武将技。只有将其生命值彻底打空，才能俘虏或击退该武将。
与配偶或结义兄弟共同上阵时，可发动「结义技」或「结缘技」。这类技能每场战斗仅能使用一次，但威力惊人，且效果会随双方关系值提升而进一步增强。
军团战中还可使用攻城器械，如冲车、井阑、攻城车及投石车等。在战场特定位置部署器械，往往能起到克敌制胜的奇效。
此外，玩家可通过堆叠称号来获取军团战加成。例如在天下武斗大会夺冠后获得的强力称号，能显著提升攻防属性。到了游戏后期，称号堆满的玩家甚至能在战场上化身「龙傲天」般的存在。