《奇迹时代：星陨》中的区域建设是游戏的重要环节。玩家最多可以占领4个区域，分为能源、食物、生产力和科研四大类。陆地区域的产出通常优于海上区域。区域初始为1级，随着科技发展可升级至3级。
区域达到3级后会获得基础特效，但这只是过渡阶段。要达到5级满级，需要考虑地形和气候属性。地形包括平原、树林、山地、废墟；气候分为极地、干燥、田园、真菌。每种地形和气候都能为特定类型的区域提供额外升级机会。
例如，在森林地形上建设生产力区域可升至4级，若再配合极地或干燥气候，就能达到5级满级。游戏中会有明显图标显示可升级状态。某些种族如亚马逊能改变地形为树林或田园，矮人能将高山变为山地再转为平原，这些改变是不可逆的。
地图上的金银铜特殊建筑具有重要战略价值。铜级自带1级，银级自带3级，金级初始就是5级。这些建筑产出资源类型固定，例如铜级发电机只能生产能源。白银和黄金建筑必定能升至5级，青铜则需要看运气。
金色建筑如公正宫殿自带帝国训练中心，能使生产兵种等级+2。若将其改建为快速学习中心，兵种等级可再+3。由于游戏兵种最高4级，这意味着可以直接生产满级单位。配合5级生产力区域的+3护盾加成，能获得既满级又额外加护盾的精英部队。
当两个特殊建筑距离较近时，一座城市可同时获得双重加成。但同类型加成无法叠加，例如两个星际飞船维护港不会使机械单位的伤害抗性叠加至+4，只有不同类型加成才能叠加。
额外技巧：攻击地图上的小势力主城（如水母、拾荒者、花朵等），必定获得4阶段英雄武器。在战役模式中，击败这些势力是获取高级装备的有效途径。
