故事起始于主角在棺材中苏醒，随后取得装备。在旅途中，他通过语音结识了海登博士与维加人工智能助手，同时也知晓了邪恶的奥利维亚博士。奥利维亚研发了空间传输技术，却意外开启了地狱之门，并在恶魔的引诱下与其达成交易。海登最初支持奥利维亚探究地狱之门，意在获取地狱的能量与知识。主角因此不断战斗，追逐奥利维亚的踪迹，并破坏了维持地狱之门稳定的能量恒定器。
与海登会面后，海登强行给主角植入了传送装置，声称是为了在危急时刻将其从地狱拉回。随后，海登指派主角寻找奥利维亚在地狱发现的人造物，主角最终找到了裁决杖（Crucible，实为一把战刀）。主角重返地狱，经历激战后夺回裁决杖，并目睹了四名战士的幻影。此后，维加出现故障，海登命令主角炸毁维加的核心以防信息泄露。
炸毁维加后，主角抵达地狱尽头，击败了被恶魔强化的奥利维亚，却被传送系统带回火星。海登阴险现身，夺走裁决杖，并扬言还会与主角再见。关于基地为何充满恶魔，海登解释称，地狱之门开启后，部分研究员变异，幸存者则被奥利维亚及其手下杀害，其余恶魔则是通过传送门降临。主角最初被恶魔封印在石棺中，因为他是恶魔畏惧的最强战士——屠戮者（Doom Slayer）。
海登支持奥利维亚是为了利用地狱资源，但事态失控。全息影像暗示海登试图扮演好人，将奥利维亚描绘成对力量极度渴望的反派，最终奥利维亚沦为恶魔的牺牲品。海登利用传输技术夺走裁决杖，揭示了他利用地狱资源的野心，虽无法杀死主角，但视其为未来的绊脚石。裁决杖似乎拥有操控恶魔的力量，而出现的四名幻影战士可能正是历代守护者的灵魂。
