第二关：大西洋快线之旅
T博士指示你前往售票室会合。沿途你会发现一名修补者正在入侵大门控制器。T博士解释说，当前的幸存者大多是这些沉迷于药物的修补者，他们已神志不清。你需要获取远程黑客工具，发射黑客飞镖来黑掉控制器，从而开启大门。
大门后方有一个损坏的安全机器人，黑掉它后便可为你作战。跟随指引前往TRAIN WORKSHOP 6A。击败两名修补者后，从左侧工具室可获得一段录音。
录音内容：Ryan声称有居民因缺乏阳光而变得神经质并感到孤独，正在寻找精神科医生。他怀疑这与战时资产充公或契卡警察的失踪事件有关。他并不在意，但提到一位名叫LAMB的女性在此领域是专家，如果她能给巨链上油，就让她去做。
向右进入安全控制室，触发剧情。LAMB现身，她认出Delta是死人，声称在他痛苦之上建立了天堂，并表示不得不除掉他，这一切都是为了爱（去你老妹的）。T博士警告说索菲亚·LAMB发现了我们。随后剧情发生，敌人围攻，地面塌陷，主角坠入水中。
T博士解释共同的敌人是索菲亚·LAMB，并指出头盔摄像机可让他看到你的视野并协助作战。出水后沿通道找到摄像机，用远程黑客工具黑掉它为你服务。T博士提醒小心，安全摄像机已归LAMB所有，但聪明的你可以让它们为你效力。
清理摄像机前的敌人后，接近玩具车触发幻觉。Eleanor呼唤父亲，称Plasmid是你的，如果她没事你就可以使用，她不想让母亲再次操控你，让你找到她。随后你获得隔空取物能力。
沿路来到大厅，看到三名修补者在下方争论。使用隔空取物将氢气瓶抛向他们可秒杀。下楼前可获得一段录音。
录音内容：亚特兰蒂斯快线的修建者Prentice Mill抱怨RAPTURE城市忘记了他，私人潜水球流行导致他的快车只能连接旧城区，但他相信这些私人载具很快会被遗忘。
下楼后仔细搜索，可在鼓风机后找到录音。内容是Eleanor与录音机的对话，她想玩分解游戏，录音机惊恐拒绝。左边厨房有另一段录音，记录了Ryan与LAMB的辩论，关于真理与幻觉，城市是否在下雨。
继续前进，大门突然关闭，一名修补者用扳手卡住了机械。LAMB通过广播警告Delta，Eleanor有特殊使命，天堂里没有他的位置。大门右侧可获得录音。
录音内容：Meltzer Mark描述修补者依赖亚当药物生存。他被修补者逼到墙角时，听到小女孩歌声，修补者立即逃跑。他因此确信女儿Cindy还活着。
售货机对面的办公室有补给和录音。LAMB在录音中谈到精神学革命，指出沮丧、恐惧、性欲反映物竞天择的压力，Ryan邀请她来此却低估了她对自然竞争法则的研究，并教导Eleanor要先了解对手才能击败。
向深处走，进入火车中转站时遭遇修补者埋伏。先黑掉监视器，快速清理敌人后进入电梯。T博士发来无线电，说明你是非常老旧的大老爹型号，生命仅与一名Little Sister关联，因分解过久系统关闭。你的Little Sister是Eleanor Lamb，被关在方丁实验室，必须尽快营救。
出电梯后捡取陷阱刺钉（不会伤害你），左侧办公室有录音。Alexander（阿尔法计划负责人，SUCHONG博士后继者）在录音中说，SUCHONG死后计划陷入困境，他接手并发现设计缺陷：大老爹仅为战斗设计，缺乏保护小妹妹的强烈关联，需要加强绑定。
按提示前进，黑掉自动售货机后，在售票处按钮找到T博士触发剧情。T博士指着小女孩说必须与LAMB战斗，她正在制造新小女孩，他必须回去拯救她们以免罪孽循环。LAMB通过广播向公民揭露Delta是敌人，下令分解并扔进海里。T博士请求防御修补者直到逃脱。
先黑掉摄像机，在洞口发射陷阱刺钉进行防御。防守成功后，T博士通过无线电感谢，称必须离开解救更多小女孩，并介绍盟友辛克莱引导寻找Eleanor。辛克莱自称金属骑士，提议做生意，搭火车去Ryan的博物馆会合。
从站台长椅找到T博士录音：LAMB占领RAPTURE，应对地表孩子被偷负责，她的修补者击沉潜艇逼他逃跑，售票厅暂时安全，辛克莱是贵重盟友。他已拯救部分萝莉，她们想回家，他希望能面对她们。进入火车后第二章结束。