根据Nicalis的创始人Tyrone Rodriguez的声明，‘以撒的结合：重生’ 的3DS版本将不支持本地多人合作模式。Tyrone还指出，该功能在发行后也不太可能通过后期更新得到补充。同时，3DS和Wii U版本之间的跨存档功能也不可用。
