《蝙蝠侠：阿卡姆起源》在发行后被曝出存在多种问题。根据各大游戏网站上玩家的反馈，这些故障和bug的严重程度超出了最初的预期。
大量玩家反映在游戏中发现了严重bug，有些问题直接破坏了游戏的完整性，导致主线剧情无法正常进行。
例如，在准备与Fire Fly作战时，需要给电梯充能，但电梯无法响应。这种情况下玩家只能返回去做支线任务或在游戏内探索。该问题已在GameFAQS上提交，华纳兄弟虽然给出了修正方案，但实际效果仍需观察。
另一个被众多玩家提及的bug发生在伯恩利通信塔。蝙蝠侠会卡在通风孔中无法移动，唯一的解决方法是退出游戏重新载入，但之后可能无法继续游戏。
Steam论坛上关于bug和故障的投诉帖子已经超过80页，玩家们的抱怨声不断。
Destructoid网站给这部蝙蝠侠系列新作打出了3.5分的评分，可见此次bug问题影响之大。